农用微生物菌剂就是将目标微生物经过工业化生产扩繁后加工制成的活菌菌剂。它具有直接或间接改良土壤、恢复地力、维持根际微生物区系平衡，降解有毒，毒、有害物质等作用；应用于农业生产，通过其中所含微生物的生命活动，增加植物养分的共供应量或促进植物生长、改善品质及农业生态环境。
微生物菌剂按照内含的微生物菌种或功能特性分为根瘤菌菌剂、固氮菌菌剂、解磷类微生物菌剂、硅酸盐微生物菌剂、光合细菌菌剂、有机物料腐熟剂、催生菌剂、菌根菌剂、生物修复菌剂。
产品按剂型分为液体、粉剂、颗粒型。
GB20287-2006微生物菌剂国标要求，微生物菌剂检测可分为技术指标和无害化两大类。具体检测项目见表2、表3要求：
由于化肥的大量使用，化肥利用率一直在下降，由此可见，单靠大量增加化肥施用量来提高作物产量是有限的，再者还有环境污染等一系列的问题。然而在这方面微生物菌剂有着独特的作用。因此，根据我国作物种类和土壤条件，采用微生物肥和化肥配合使用，不仅可以保证增产，而且减少化肥的使用量，改善土壤和作物的品质，减少污染。
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